Shabaka è cresciuto tra Birmingham e le Barbados prima di tornare nel Regno Unito per studiare clarinetto classico. In seguito è passato al sassofono e si è immerso nella scena jazz del sud di Londra. Leader della band Shabaka & The Ancestors, ha fatto parte anche dei gruppi The Comet Is Coming e Sons of Kemet fino al loro scioglimento nel 2022/23. Alla fine del 2023, Shabaka ha deciso di abbandonare il suo strumento principale, il sassofono, per concentrarsi sul perfezionamento del flauto giapponese Shakuhachi. Il suo album solista "Perceive Its Beauty, Acknowledge Its Grace", pubblicato nel 2024 da Impulse!, rappresenta l'inizio di questa nuova transizione musicale e vede la partecipazione di artisti come André 3000, Lianne La Havas e Floating Points.